Дед Калян, некоторые антивирусные экраны "жуют" файлы при закачке из сети и могут испортить образ, иногда сетевой экран приходится отключать на время закачки. Но могут быть и другие причины отказа в загрузке.
Если после длительного хранения на винчестере файл оказался "испорченным", то стоит проверить диск на наличие ошибок с их исправлением, иначе такая ситуация может повториться и с другими файлами.
Думаю, обратили внимание на то, что в загрузочном меню Windows флешки с разным загрузочным софтом отображаются по разному - как USB HDD, USB Flash Drive, USB CD/DVD и т.п.
Когда на один носитель монтируешь софт из разных источников, подготовленный разными загрузчиками - проблемы неизбежны.
При компоновке разных зарузочных образов на общий носитель на это стоит обращать пристальное внимание.