Если на флешке после форматирования, перед записью образа уже был создан файл autorun.inf (можно увидеть в Total Commander или в проводнике при включенном отображении скрытых системных файлов), то это точно вирус прописал свой хвост, придется чистить.
Если же на флешка была чиста от вируса, то это антивирус блокирует процесс записи файла autorun.inf, потому что он похож на вирус, хоть им и не является.
Благодаря файлу autorun.inf флешка в проводнике называется Game-Edition и имеет соответствующую желтую пиктограмму. Без этого файлика флешка отображается в проводнике просто как флешка и ее название - как было выставлено ранее.
Если невозможно записать только файл аutorun.inf, а остальные файлы до и после него пишутся нормально, то проблемы нет вообще, на загружабельность флешки и установку с нее винды это никак не влияет. Если же антивирус вообще обрывает процесс создания загрузочной флешки, то нужно на время создания флешки выключить антивирусную защиту.