Я проверку проводил на флешке Kington Data Traveler, всё поместилось

Формула тут проста, т.к. производители накопителей считают, что в килобайте 1000 байт, в мегабайте - 1000 килобайт и т.д., вместо 1024, то тогда у нас получается:

256*1000*1000=256.000.000/1024=250.000/1024=244,14 МБ реально находится на 256 мегабайтной флешке.
Распакованная сборка a-1 весит 234 МБ.
Bootice определяет данную флешку как 246 метровую

При форматировании в разные файловые системы размер флешки у нас получается:

NTFS - 243 МБ (свободно 220 МБ)
FAT32 - 239 МБ (свободно 239 МБ)
FAT16 - 242 МБ (свободно 242 МБ)
exFAT - 242 МБ (свободно 242 МБ)

Походу на твоей флешке ещё сильнее занизили стандарты.

Собственно попробуй в бутайсе отформатировать флешку в FAT16, по идее должен отыграть эти мегабайты.