Вы напустили слишком много пафосных заумных фраз в вопросе, так что он выглядит умнее, чем он есть на самом деле. Но все равно, на ваш вопрос все еще можно как-то ответить.
1.Главная загрузочная запись диска (MBR) создается и изменяется той операционной системой, которую на него ставят (будь то любая винда, то ли линукс или макось). Если инсталлятору винды запретить вносить свои изменения в mbr, то она просто не установится. Если после ХР ставить Windows 7 на другой раздел, та внесет свои изменения в mbr, но также пропишет загрузку ХР как пункт в загрузчик семерки. Если ставить какой-то полновесный дистрибутив линукса, он сделает свои изменения в mbr, и в свой загрузчик (GRUB или LILO) впишет пункты загрузчика винды (или группы разных Windows). Загрузчик Grub4Dos, используемый некоторыми легковесными дистрибутивами линукса, а также многими загрузочными флешками, способен на равных вписать в себя загрузочные записи от разных версий винды и линукса (и не только их). Поэтому хватит философствовать общими фразами, расскажите пожалуйста попродробнее, какие операционные системы и в какой последовательности вы хотите подружить на одном жестком диске. Даже для одной конкретной ситуации существует до десятка вариантов решения, а для общей ситуации (когда ничего не указано) ответ абсолютно неопределенный.
2.Какая вам собственно разница, как ХР-шный ntldr называет многочисленные разделы ваших двух жестких дисков. Эта информация хранится только в самом загрузчике ХР (в файле boot.ini), и никуда не записывается за пределами системного раздела XP. Так что в данном случае ваши страхи необоснованы.
3. На этот вопрос лично не знаю ответа. Зато знаю, что есть способ все сделать намного проще. Для этих целей пользуюсь Акронисом. Acronis Disk Director для форматирования разделов и переразбивки дисков, аналог линуксовского gparted. Acronis True Image - для создния резервных копий разделов и последующего восстановления этих разделов из резервной копии в любое место на жестком диске. Данная программа также способна запомнить конфигурацию mbr и при желании ее восстановить. Эти программы способны свободно работать как с виндовыми файловыми системами (FAT32, NTFS), так и с линуксовскими (Ext2, Ext3, Ext4, ReiserFS). Правильное использование этих двух программ способно создать любую комбинацию разделов с разнообразными операционными системами.
