Resident, раз при включении определяется наличие всех трех HDD, значит в настройках BIOS они все должны быть видны.
1. Проверьте режимы подключения 3-го диска:
    a) Перемычка (джампер) Masier - Slave на самом диске.
    b) Разъём на шлейфе, соответствующий выбранному джампером режиму. (Да и сам шлейф не мешает проверить - часто именоо они являются причиной подобных неприятностей).
2. Войдите в BIOS Setup, проверьте и, при необходимости, откорректируйте настройки режимов HDD.
3. В разделе Boot обязательно выставьте первым загрузочным устройством диск с системой (эти настройки могли измениться после подключения 3-го HDD).

Если все сделаете правильно и диски гарантированно рабочие, то система (если она в порядке) должна загрузиться.
Потом уже можно будет подумать и про обновление прошивки BIOS.

Возможно, но не обязательно - сначала проверьте корректность режимов в BIOS Setup.

Resident, здесь не очень подходящее место для ликбеза по BIOS Setup.
Зайдите на сайт производителя материнской платы и поищите мануал и скриншоты режимов BIOS с описаниями.
Поищите в сети информацию по Вашей версии BiOS - таковой предостаточно.
Пока самостоятельно не освоите работу с BIOS Setup - так и будете топтаться на месте.
Или пригласите на помощь более опытного друга. Но я бы рекомендовал первый путь - друг уйдет и унесет знания с собой.
А всё, что наработаете сами - останется с Вами навсегда!
Удачи!