JA7N, сразу после установки системы идет активная фрагментация файлов, что приводит к падению скорости их считывания плюс накопление мусора в виде разных временных файлов. Через 2-3 дня использования системы внутренние процессы ОС стабилизируются и фрагментация замедляется.
Проведите дефрагментацию дисков и очистку системы от мусора.